A “Pontificium Collegium Germanicum et Hungaricum” képzési programjának célja a személyiség egészének fejlődése, a lelki növekedés, a tanulmányokban való előrehaladás és a pasztorális ismeretek bővítése. A képzés egyik fontos aspektusa az akadémiai tanulmányok, aminek feladata, hogy “a filozófiai és teológiai tartalmak alapos és összefüggéseiben megértett ismeretére vezessen, és a hit szolgálatának egy tudományosan megalapozott formájának ellátására tegyen alkalmassá”. (Ordo 28)

A CGU lakói alapvetően a Pápai Gergely Egyetemre járnak. A Gerely-egyetem különlegességét az adja, hogy diákjai és professzorai a világ minden részéről érkeznek. Az egyház katolicitása így konkrétan tapinthatóvá válik. Az oktatás nyelve a kötelező kurzusokon mindig olasz. Egyéb akadémiai rendezvények, vizsgák azonban további 6 nyelven is folyhatnak.

A kétéves filozófiai alapképzés után (amit általában mindenki saját országában végez) hároméves teológiai képzés következik, amely szisztematikusan nyújt bevezetést a teológia minden fontosabb kérdésébe, végül pedig egy bakkalaureátusi munka megírásával zárul. Egy pasztorális év után specializáció következik. A licenciátusi fokozat megszerzéséhez szükséges két vagy három év a CGU képzésének fontos részét alkotják. Ennek a további, speciális tanulmányi fokozatnak a megszerzése történhet a Gregoriánán, de más pápai egyetemeken és intézeteken is. A tanulmányi terület kiválasztása a diák saját képességei és érdeklődése szerint valamint saját egyházmegyéjének szükségleteinek figyelembe vételével történik meg. A további specializáció elérésére doktori fokozat megszerzése is lehetséges.

Az akadémiai tanulmányokat a kollégium tovább programokkal egészíti ki, melyek előadói Olaszországból vagy a diákok származási országaiból érkezhetnek, az egyházi, politikai-társadalmi vagy kulturális kérdések megvitatására.